Acteur essentiel de la santé en France, l’EFS assure le lien entre les besoins des malades et la générosité des donneurs. Dans ce cadre, sa mission première, souhaitée par le législateur, consiste à assurer l'autosuffisance de la France (DOM compris) en produits sanguins.

Le don du sang est indispensable et irremplaçable pour sauver des vies. Dans les 17 établissements régionaux qui le composent, l’EFS dispose donc du monopole des activités de collecte, préparation, qualification, distribution des produits sanguins labiles. L’EFS assure souvent également l’immunohématologie receveurs, c’est à dire qu'il vérifie la compatibilité entre les caractéristiques du receveur et celles du produit qui lui est destiné.